Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSNK2A1P68400 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms