Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms