Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERVK_113P62684 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HERVK_113P62684 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms