Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAP25P60880 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAP25P60880 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms