Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAPAP54920 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPAP54920 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPAP54920 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPAP54920 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms