Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LUMP51884 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LUMP51884 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms