Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SMARCA2P51531 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SMARCA2P51531 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SMARCA2P51531 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms