Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCLCP48506 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCLCP48506 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GCLCP48506 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms