Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCAMP43121 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCAMP43121 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCAMP43121 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCAMP43121 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms