Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms