Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASRP41180 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASRP41180 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASRP41180 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASRP41180 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASRP41180 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms