Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP62P37198 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP62P37198 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP62P37198 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NUP62P37198 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms