Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM23P36406 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms