Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT2P35908 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT2P35908 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms