Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD1P33897 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD1P33897 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD1P33897 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD1P33897 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCD1P33897 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms