Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC1P33527 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC1P33527 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC1P33527 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms