Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSG3P32926 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms