Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC9P31274 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC9P31274 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms