Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA5P30532 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA5P30532 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms