Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND2P30279 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND2P30279 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND2P30279 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND2P30279 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND2P30279 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms