Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PEX2P28328 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms