Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSFA2P28290 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms