Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms