Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMLP26374 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms