Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
DNMT1P26358 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DNMT1P26358 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms