Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRBP23467 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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