Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms