Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NR4A1P22736 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms