Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGCP20142 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGCP20142 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGCP20142 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGCP20142 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGCP20142 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGCP20142 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms