Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNNI3P19429 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNNI3P19429 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms