Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR1P18146 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR1P18146 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EGR1P18146 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EGR1P18146 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms