Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPI1P17947 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPI1P17947 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPI1P17947 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms