Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCL3L1P16619 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCL3L1P16619 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms