Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB4P16144 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB4P16144 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms