Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DOBP13765 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DOBP13765 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms