Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A1P11836 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms