Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRFP10586 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRFP10586 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms