Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM225BP0DP42 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms