Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD1P0DJD0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD1P0DJD0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms