Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MMP10P09238 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP10P09238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MMP10P09238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MMP10P09238 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms