Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NGFRP08138 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NGFRP08138 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms