Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCCAP05165 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCCAP05165 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCCAP05165 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCCAP05165 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCCAP05165 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms