Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EGFRP00533 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EGFRP00533 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EGFRP00533 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms