Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRD1O95696 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRD1O95696 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRD1O95696 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRD1O95696 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms