Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA4O75676 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms