Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSCO60682 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSCO60682 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSCO60682 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MSCO60682 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSCO60682 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSCO60682 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSCO60682 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms