Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYTH3O43739 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms