Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM6AO15550 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms