Protein–RNA interactions for Protein: O00560

SDCBP, Syntenin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBPO00560 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SDCBPO00560 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms