Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIK3CDO00329 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIK3CDO00329 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms